根据中国人民银行的规定，商家在使用POS机刷自己的银行卡时，应当遵守相应的规范和限制。以下是一些考虑因素和建议：

考虑日常交易金额：商家在刷自己的卡时，应当根据实际交易情况来确定每次刷卡的金额。如果商家经营的是小额消费场所，比如零售店、餐饮店等，适宜选择较低的刷卡金额，以符合顾客习惯和支付便利。

遵守支付渠道规定：不同的支付渠道可能对商家自身刷卡设定有一定的限制。商家可以咨询具体的支付渠道或POS机提供商，了解相应的规定和建议。例如，有些支付渠道可能对单笔交易金额有限制，超过限额可能需要特殊申请或进行分批处理。

存在风险意识：商家在刷自己的卡时，需要注意相关的风险因素。例如，若频繁刷卡且金额异常大，可能引起银行的反欺诈风控系统的警觉，导致卡片被冻结或限制。商家也需留意自身资金流动和偿债能力，以避免因大额刷卡导致资金周转不畅或逾期还款等问题。

考虑成本和手续费：POS机商家在刷自己的卡时，还需考虑支付相关的成本和手续费。一般来说，商家支付给银行或支付渠道的手续费是与交易金额相关的，较大的交易金额可能导致更高的手续费成本。商家需要权衡利弊，并确保刷卡的收益能够覆盖相应的费用。

综上所述，POS机商家在刷自己的卡时应当根据实际情况和规定进行合理的金额选择。建议商家根据日常交易金额、支付渠道规定、风险意识和成本考量等因素，合理设定每次刷卡的金额。同时，商家也可以咨询具体的支付服务提供商，以获取更详细的建议和相关信息。